贯穿和贯串的主要区别是：意思不同、出处不同、用法不同；具体如下：
一、意思不同：
1、贯串意思指从头到尾穿过一个或一系列事物。
2、贯穿意思指通达，贯通。
二、出处不同：
1、贯串出自前蜀·贯休《上冯使君水晶数珠》诗：“泠泠瀑滴清，贯串有规程。”
2、贯穿出自《汉书·司马迁传》：“亦其涉猎者广博，贯穿经传，驰骋古今。”
三、用法不同：
1、贯串示例：
把上下联贯串起来看，它的意思更加明显，就是说一面要致力读书，一面要关心政治。
2、贯穿示例：
语言是一个民族神经贯穿世世代代，将他们联结成为一个共同的、持久的和进步的实体。